ライノウィルス外殻蛋白質の７００ピコ秒の分子動力学計算

○米田 茂隆	よねだ しげたか		北里大理
  米田 照代	よねだ てるよ		北里大薬
  梅山 秀明	うめやま ひであき	北里大薬

風邪の主要な病原であるライノウィルスの外殻蛋白質は外径３００Åという巨
大な球殻状の分子集合体であり、単に内部に遺伝子を保護、運搬するだけでな
く、ライノウィルスの感染、増殖に関して精巧な機能をもつ。我々は、特に宿
主細胞への吸着と脱殻のメカニズムの解明を目的として、我々が開発した回転
対称性境界条件という独自の方法により、ライノウィルスの外殻蛋白質の７０
０ピコ秒の分子動力学計算を行った。このような巨大分子集合体のこのような
長時間計算は少ない。その分子動力学計算の原子運動の軌跡をもとに、従来の
ような個々の蛋白質構造の変化よりも、むしろ、外殻蛋白質中で各蛋白質がど
のように並進、回転の運動をしているかに焦点をあて、その集団運動の解析を
行った。その結果より、ライノウィルス外殻蛋白質が脱殻を開始する部分を議
論した。